Les Verrières suisses s'étendent au fond d'un vallon qui descend vers la France. Le village principal se trouve à 930 mètres d'altitude; le hameau de Meudon se trouve un peu plus à l'ouest, juste avant la frontière. Une grand partie de la commune est composée de forêts et de pâturages situés entre 1100 et 1200 mètre d'altitude.

Les Verrières n'étaient pas aussi isolées que pourrait nous le faire croire leur situation: en effet, elles se trouvaient sur une voie de communication importante entre la Suisse et la Bourgogne.

L'ancienne mairie des Verrières était composée de cinq petis villages, ou bourgeaux: le Grand Bourgeau et Belleperche (formant l'actuel village des Verrières), Meudon, Grand Bayard et Petit Bayard. La Côte-aux-Fées fit également longtemps partie de la mairie des Verrières. En 1878, les trois premiers borgeaux fusionnèrent en une nouvelle commune, celle des Verrières, tandis que les Grand et Petit Bayard formèrent plus tard l'actuelle commune des Bayard.

Les Verrières, appelées à l'époque Mijoux, furent peuplées vers le 13è siècle. Une immigration naturelle dut se faire depuis la France. Les souverains de Neuchâtel encouragèrent le peuplement de ces terres en y installant des colons étrangers (francs-habergeants) et en accordant des franchises (privilèges fiscaux) au habitants. Les Verrières adhérèrent à la réforme protestante en 1534.